Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms