Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms