Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUX4Q9UBX2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4Q9UBX2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms