Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEF1Q9UBV8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms