Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK3Q9UBP4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK3Q9UBP4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms