Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms