Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH10Q9P2E7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDH10Q9P2E7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms