Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNTN3Q9P232 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms