Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf78Q9NZ63 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.57■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.55■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.55■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms