Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DLL3Q9NYJ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms