Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY99

SNTG2, Gamma-2-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG2Q9NY99 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG2Q9NY99 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTG2Q9NY99 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms