Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOR4AQ9NXH8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOR4AQ9NXH8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TOR4AQ9NXH8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOR4AQ9NXH8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TOR4AQ9NXH8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOR4AQ9NXH8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOR4AQ9NXH8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR4AQ9NXH8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms