Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2orf42Q9NWW7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf42Q9NWW7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms