Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAK1IP1Q9NWT1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAK1IP1Q9NWT1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms