Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPTLC3Q9NUV7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms