Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC3Q9NUD5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC3Q9NUD5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms