Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TM7SF3Q9NS93 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms