Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms