Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2B1Q9NRF2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SH2B1Q9NRF2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms