Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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