Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR9Q9NR96 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms