Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF4Q9NR80 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
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