Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM10Q9NQV6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM10Q9NQV6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM10Q9NQV6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms