Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INCENPQ9NQS7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
INCENPQ9NQS7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms