Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FZD3Q9NPG1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms