Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIX2Q9NPC8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX2Q9NPC8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms