Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms