Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms