Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUFT1Q9NNX1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUFT1Q9NNX1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms