Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TNRC6CQ9HCJ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRC6CQ9HCJ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRC6CQ9HCJ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms