Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms