Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP29Q9HBJ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms