Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDFQ9HBH1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms