Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SP110Q9HB58 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP110Q9HB58 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms