Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRKRIP1Q9H875 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms