Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUDS3Q9H7L9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms