Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms