Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XKR8Q9H6D3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XKR8Q9H6D3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XKR8Q9H6D3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XKR8Q9H6D3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XKR8Q9H6D3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XKR8Q9H6D3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XKR8Q9H6D3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XKR8Q9H6D3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
XKR8Q9H6D3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XKR8Q9H6D3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms