Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM12Q9H4Q4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms