Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms