Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms