Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms