Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM49AQ9H0Q0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms