Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC113Q9H0I3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms