Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDGFDQ9GZP0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms