Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms