Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZYG11BQ9C0D3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZYG11BQ9C0D3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms