Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms