Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
INO80BQ9C086 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms