Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM5Q9C035 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms